时间设定在《刺猬索尼克2》与《刺猬索尼克3》之间，纳克鲁斯同意收韦德威波为徒、并将他训练成真正的针鼹战士。

索尼克在绿丘镇安顿下来之后，就急着要证明自己有能力成为一名真正的英雄。 当蛋头博士带着全新的搭档纳克鲁斯，又回来寻找一块力量强大足以毁灭人类文明的翡翠的时候，他就面对了另一个严峻的考验。 这次索尼克和他自己的跟班塔尔斯携手合作..