神秘的电子邮件，是黑客入侵?是恐吓勒索?还是病毒?可怕的放射物质外泄，是恐怖事件?还是意外事故?……大案重案，一案接一案，案情扑朔迷离，危机四伏!公安刑警杨震(丁志成饰)打入犯罪集团做卧底，突然面临被识破的危险，季洁(王茜饰)、郑一民(张潮饰)率重案六组刑警紧急前往解救……面对一系列高科技犯罪案，重案六组全力追查，真相一步步浮出水面。经历生死的考验，常保乐（侣萧饰）与各办案人员的情谊更加深厚，季洁对杨震日渐生情，丁箭（王挺饰）开始暗恋田蕊（孙菲菲饰）……第二部坚持一集两个故事的原则，风格依然会延续第一部紧张激烈、悬念迭生的特点。打造超越版据导演徐庆东介绍，之所以把这部片子称为《重案六组》第二部，而不是称其为续集，就是为了要超越第一部。在保持第一部写实风格的同时，剧组人员把《重案六组》第二部作为第一部的超越版来拍摄。徐庆东认为，《重案六组》第一部之所以取得了良好成绩，警察说“像”，老百姓说“好”，专家挑不出大毛病，主要是因为它拍得真实。第二部要想做得更出色，仍然要坚持真实感，反对矫揉造作，反对矫情，反对想当然。新案例，新感觉《重案六组》第一部的剧本创作，30集仅用两个月完成，然而续集的剧本则足足写了半年。徐庆东介绍说，每集的编剧用呕心沥血来形容，一点不夸张。一集记录两个案子，情节基本取材于新近发生的案例，更追求典型性、新闻性和时效性，以便贴近观众的现实生活。在第二部里面，观众可以看到，无论是从画面上还是从细节的处理上，都明显好于第一部。题材上也有大幅度的创新，出现了大量的高智商犯罪、高智商侦破的案例使整个剧情突出了一种现代气息，从而也更能俘获观众的心。