2039年,已经从蝙蝠侠退隐下来的 BRUCE WAYNE布鲁斯 韦恩与他的爱犬ACE(王牌) 隐居在NEO-GOTHAM新高谭市.
TERRY McGINNIS 泰瑞,一位16岁的高中生运动员,常因自己莫名其妙的正义感而惹上麻烦~某日他为了保护无辜的列车乘客与女友,TERRY惹上了最兇恶的帮派 JOKERZ!! TERRY逃到BRUCE的住处,BRUCE帮TERRY击退JOKERZ,但年事已高的BRUCE心臟无法负荷这样激烈的活动,於是TERRY搀扶著 BRUCE回到他的宅院,就在这时候TERRY发现了 BATCAVE蝙蝠洞,他也知道面前这位救了他的老先生就是传说中的蝙蝠侠!! 清醒过来的BRUCE生气的将TERRY赶出他的宅第........
TERRY回家发现他的父亲被JOKERZ杀害了,他调查后发现真正的幕后黑手是DEREK POWERS,合并WAYNE企业成立 WAYNE-POWERS集团的总裁!! TERRY的父亲在DEREK 的旗下工作,他父亲发现DEREK暗中生产非法的生化武器,因而被杀人灭口!!
悲愤的TERRY从BRUCE那儿偷穿走高科技的蝙蝠装,并说服BRUCE得到他的协助,TERRY成功的打败DEREK POWER ,粉碎其阴谋!(DEREK POWERS后来被化学气体与辐射线影响,变成一个半透明状的怪物BLIGHT)
之后BRUCE 认为新高谭市还是需要一位黑夜中的正义骑士,他也觉得TERRY会是个可造之才,所以雇用TERRY成为他的助理,并训练指导他成为能独当一面的未来蝙蝠侠BATMAN BEYOND!!
岁月不饶人，长期以来守护高谭市的布鲁斯韦恩，亦即正义化身"蝙蝠侠"也逃不过时间的无情魔掌而逐渐步入迟暮之年，而他的死对头"小丑"更决定趁此大好时机准备大闹高谭市；但这位爱兴风作浪的跳梁小丑却万万没想到，新任蝙蝠侠泰瑞早已作好万全准备，就等著他自投罗网；在了解前任蝙蝠侠布鲁斯和小丑最后一次对决的情况后，泰瑞更决心要为良师讨回公道，将小丑永远赶出高谭市！面对诡计多端的邪恶匪徒，新上任的超级英雄即将大展伸手，带给忠实影迷不一样的蝙蝠侠。